Par la Dr. Marta Martinelli, Biologiste Nutritionniste à l’Aventino Medical Group, Rome
Introduction
Le microbiome intestinal est un écosystème complexe composé de divers micro-organismes qui jouent un rôle fondamental dans notre organisme. Sa composition est fortement influencée par l’alimentation et régule des processus physiologiques essentiels au bien-être général.
Un microbiome sain est associé à une bonne digestion, un système immunitaire fort et un état émotionnel équilibré. À l’inverse, un microbiome déséquilibré favorise l’inflammation chronique, l’obésité, le diabète, l’insomnie et les troubles de l’humeur.

À l’Aventino Medical Group à Rome, notre équipe de nutritionnistes et de spécialistes propose des consultations personnalisées pour aider les patients à améliorer leur santé intestinale grâce à une alimentation équilibrée et adaptée.
Le rôle du microbiome intestinal dans le métabolisme et la santé
En tant que professionnelle de la nutrition, j’aide mes patients à comprendre l’importance du microbiome intestinal, qui est composé de milliards de micro-organismes remplissant des fonctions essentielles pour le corps humain, notamment :
- Régulation du métabolisme : Influence l’extraction d’énergie des aliments et le stockage des graisses.
- Absorption des nutriments : Facilite la digestion et, grâce à la fermentation des fibres, produit des acides gras à chaîne courte, comme l’acide butyrique, qui protège contre l’inflammation et les cancers intestinaux.
- Régulation du système immunitaire : Module la réponse inflammatoire et protège contre les infections.
- Communication intestin-cerveau : Grâce au système nerveux entérique, l’intestin communique de manière bidirectionnelle avec le système nerveux central. Le microbiome influence le cerveau via les systèmes endocrinien, immunitaire et métabolique, en produisant des molécules capables d’affecter le développement, la maturation, le vieillissement et l’équilibre du système nerveux.
Alimentation et microbiome : quels aliments favorisent l’équilibre bactérien ?
Une alimentation riche en nutriments spécifiques peut soutenir un microbiome sain et prévenir les déséquilibres responsables de troubles métaboliques et inflammatoires. Voici quelques groupes alimentaires clés :
Aliments riches en fibres
Les fibres alimentaires agissent comme des prébiotiques, nourrissant les bonnes bactéries intestinales. Les principales sources de fibres sont :
- Légumes à feuilles vertes (épinards, chou frisé, blettes)
- Légumineuses (pois chiches, lentilles, haricots)
- Fruits frais et secs (pommes, poires, noix)
- Céréales complètes (avoine, quinoa, épeautre)

Polyphénols : de puissants alliés du microbiome
Les polyphénols sont des composés végétaux aux propriétés antioxydantes qui favorisent la croissance des bactéries bénéfiques et réduisent l’inflammation. Ils sont présents dans :
- Les baies (myrtilles, framboises, groseilles)
- Le thé vert
- L’huile d’olive extra-vierge
- Les épices (curcuma, gingembre, cannelle)
Probiotiques : présents dans les aliments fermentés
Les probiotiques sont des bactéries vivantes qui enrichissent la flore intestinale, en favorisant son équilibre. Les sources naturelles de probiotiques comprennent :
- Yaourt et kéfir
- Fromages affinés
- Miso et tempeh
- Kombucha
Effets d’une alimentation déséquilibrée sur le microbiome
Une alimentation riche en sucres raffinés, en aliments ultra-transformés et pauvre en fibres peut provoquer une dysbiose intestinale, caractérisée par :
- Inflammation chronique : Augmente le risque de maladies auto-immunes et cardiovasculaires.
- Prise de poids et résistance à l’insuline : Perturbe la régulation du métabolisme, favorisant le diabète et les maladies chroniques.
- Troubles de l’humeur et du sommeil : Un microbiome déséquilibré peut stimuler la production de cytokines pro-inflammatoires, contribuant à l’insomnie et aux troubles de l’humeur.

Stratégies pour améliorer le microbiome grâce à la nutrition
- Adopter une alimentation variée riche en fibres et polyphénols.
- Éviter les aliments industriels riches en sucres et en graisses saturées.
- Consommer des aliments fermentés pour bénéficier des probiotiques qu’ils contiennent.
- Boire suffisamment d’eau pour favoriser le transit intestinal.
- Maintenir un mode de vie actif, car l’exercice physique favorise la diversité microbienne.
Liens avec d’autres disciplines médicales et institutions
Un microbiome sain ne se limite pas à la digestion, il a un impact sur de nombreuses disciplines médicales, notamment :
- Psychologie et Psychiatrie : Le microbiome intestinal est impliqué dans la production de neurotransmetteurs (sérotonine, GABA), influençant l’humeur et le bien-être mental.
- Immunologie : Une flore intestinale équilibrée aide à moduler les réponses immunitaires, réduisant ainsi le risque de maladies auto-immunes et inflammatoires.
- Cardiologie : Certaines bactéries intestinales participent à la santé cardiovasculaire, en régulant le métabolisme des graisses et les niveaux de cholestérol.
Pour approfondir le lien entre nutrition et santé intestinale, vous pouvez consulter des sources de référence telles que :
- Organisation Mondiale de la Santé (OMS) – https://www.who.int/
- National Institutes of Health (NIH) – https://www.nih.gov/
- Société Italienne de Nutrition Humaine (SINU) – https://www.sinu.it/

FAQ – Questions fréquentes sur le microbiome intestinal
Quels sont les symptômes d’un microbiome déséquilibré ?
Les symptômes les plus courants incluent ballonnements, troubles digestifs, intolérances alimentaires, fatigue, maux de tête et troubles de l’humeur.
Quels aliments nuisent au microbiome ?
Les aliments riches en sucres raffinés, ultra-transformés, en graisses saturées et la consommation excessive d’alcool peuvent compromettre la diversité bactérienne intestinale.
Combien de temps faut-il pour améliorer le microbiome avec l’alimentation ?
Des changements peuvent être observés en quelques semaines, grâce à une alimentation personnalisée riche en fibres, probiotiques et aliments naturels.
Les compléments probiotiques sont-ils vraiment efficaces ?
Oui, dans de nombreux cas, ils peuvent être bénéfiques, mais il est préférable de consulter un spécialiste pour choisir le produit le plus adapté, en complément d’une alimentation équilibrée.
Conclusion
Un microbiome sain est essentiel au bien-être physique et mental. Grâce à une alimentation adaptée et un mode de vie équilibré, nous pouvons préserver notre santé intestinale et prévenir de nombreuses pathologies.
En tant que nutritionniste, je m’engage à aider mes patients à comprendre l’importance du microbiome et à adopter des stratégies nutritionnelles ciblées pour améliorer leur santé.📌 Pour plus d’informations ou pour prendre rendez-vous, visitez la page du Dr. Martinelli ici.